中药化学学科由5个发展稳定、特色突出的研究方向构成学科体系，包括中药特性化学研究、中药代谢化学研究、中药质量化学研究、中药合成化学研究和中药应用化学研究。以中药复方化学研究为重点，以中药特性化学、代谢化学、质量化学、合成化学和应用化学研究为主轴，阐明中药特性本质与中药化学的关联性，培养适用人才、形成关键基础、开发创新药物，构建中药化学学科知识原创体系和学科应用转化体系。中药化学学科成员作为主编或副主编参与编写了多部规划教材，并致力于将科研成果应用于教材和教学中。